| 決勝 | ||||||
| 2004/08/08 (Sun) | 会場：島根県立サッカー場 | |||||
| 54 | 国見高校 | 2V | 0-0 1-1 1-0 | 1 | 市立船橋高校 | |
| 準決勝 | ||||||
| 2004/08/07 (Sat) | 会場：島根県立サッカー場 | |||||
| 52 | 国見高校 | 3 | 1-0 2-0 | 0 | 前橋育英高校 | |
| 53 | 市立船橋高校 | 1 | 0-0 1-0 | 0 | 成立学園 | |
| 準々決勝 | ||||||
| 2004/08/06 (Fri) | 会場：益田運動公園自由広場 | |||||
| 49 | 桐光学園 | 0 | 0-1 0-2 | 3 | 前橋育英高校 | |
| 51 | 韮崎高校 | 1 | 0-2 1-1 | 3 | 成立学園 | |
| 会場：益田陸上競技場 | ||||||
| 48 | 国見高校 | 0 | 0-0 0-0 5PK4 | 0 | 滝川第二高校 | |
| 50 | 市立船橋高校 | 1 | 1-0 0-0 | 0 | 草津東高校 | |
| 3回戦 | ||||||
| 2004/08/04 (Wed) | 会場：益田運動公園自由広場 | |||||
| 42 | 関大第一高校 | 0 | 0-1 0-0 | 1 | 桐光学園 | |
| 44 | 市立船橋高校 | 1 | 0-0 1-0 | 0 | 鹿児島実業高校 | |
| 会場：益田陸上競技場 | ||||||
| 43 | 米子北高校 | 1 | 0-1 1-1 | 2 | 前橋育英高校 | |
| 45 | 草津東高校 | 1 | 0-0 1-0 | 0 | 仙台育英学園 | |
| 会場：三隅中央公園町民陸上競技場 | ||||||
| 41 | 滝川第二高校 | 8 | 4-1 4-1 | 2 | 盛岡商業高校 | |
| 47 | 履正社高校 | 0 | 0-0 0-1 | 1 | 成立学園 | |
| 会場：ひだまりパークみとサッカー競技場 | ||||||
| 40 | 国見高校 | 2 | 1-0 1-1 | 1 | 済美高校 | |
| 46 | 羽黒高校 | 1 | 1-0 0-2 | 2 | 韮崎高校 | |
| 2回戦 | ||||||
| 2004/08/03 (Tue) | 会場：島根県立サッカー場 | |||||
| 24 | （長崎） 国見高校 | 2 | 2-0 0-1 | 1 | 近大和歌山高校 | |
| 29 | 桐光学園 | 2 | 0-1 2-0 | 1 | 佐賀東高校 | |
| 会場：益田運動公園自由広場 | ||||||
| 27 | 盛岡商業高校 | 4 | 2-1 2-2 | 3 | （山口） 多々良学園 | |
| 39 | 平工業高校 | 2 | 1-0 1-2 3PK4 | 2 | （東京2） 成立学園 | |
| 36 | （宮崎） 鵬翔高校 | 2 | 1-2 1-1 | 3 | 羽黒高校 | |
| 会場：益田陸上競技場 | ||||||
| 26 | 滝川第二高校 | 5 | 3-0 2-2 | 2 | 西武台高校 | |
| 38 | 那覇西高校 | 0 | 0-0 0-1 | 1 | 履正社高校 | |
| 34 | （島根1） 立正大淞南高校 | 2 | 0-2 2-0 10PK11 | 2 | 草津東高校 | |
| 会場：三隅中央公園町民陸上競技場 | ||||||
| 30 | 米子北高校 | 4 | 1-0 3-4 4PK3 | 4 | 青森山田高校 | |
| 32 | （千葉2） 市立船橋高校 | 2 | 0-0 2-0 | 0 | 作陽高校 | |
| 37 | 丸岡高校 | 0 | 0-1 0-0 | 1 | 韮崎高校 | |
| 会場：ひだまりパークみとサッカー競技場 | ||||||
| 31 | 前橋育英高校 | 3 | 1-0 2-0 | 0 | （愛知1） 東海学園 | |
| 28 | （大分） 大分情報科学高校 | 0 | 0-0 0-2 | 2 | 関大第一高校 | |
| 35 | 仙台育英学園 | 1 | 0-0 1-0 | 0 | （岐阜） 各務原高校 | |
| 会場：島根県立益田産業高等学校グラウンド | ||||||
| 33 | 鹿児島実業高校 | 1 | 1-0 0-1 4PK2 | 1 | 大宮東高校 | |
| 会場：島根県立益田工業高等学校グラウンド | ||||||
| 25 | 済美高校 | 3 | 2-1 1-0 | 1 | 室蘭大谷高校 | |
| 1回戦 | ||||||
| 2004/08/02 (Mon) | 会場：島根県立サッカー場 | |||||
| 15 | （埼玉2） 大宮東高校 | 1 | 1-1 0-0 5PK3 | 1 | （熊本） 大津高校 | |
| 21 | （奈良） 市立一条高校 | 1 | 0-1 1-0 4PK5 | 1 | （沖縄） 那覇西高校 | |
| 9 | （佐賀） 佐賀東高校 | 4 | 2-0 2-2 | 2 | （島根2） 益田高校 | |
| 会場：益田運動公園自由広場 | ||||||
| 11 | （青森） 青森山田高校 | 2 | 2-0 0-0 | 0 | （福岡） 東海大第五高校 | |
| 2 | （愛媛） 済美高校 | 3 | 1-0 2-1 | 1 | （富山） 富山第一高校 | |
| 19 | （神奈川2） 座間高校 | 1 | 1-1 0-0 2PK4 | 1 | （福井） 丸岡高校 | |
| 会場：益田陸上競技場 | ||||||
| 6 | （三重） 暁高校 | 1 | 0-0 1-2 | 2 | （岩手） 盛岡商業高校 | |
| 12 | （静岡） 藤枝東高校 | 1 | 0-0 1-1 3PK4 | 1 | （群馬） 前橋育英高校 | |
| 7 | （徳島） 城ノ内高校 | 2 | 0-2 2-1 | 3 | （大阪2） 関大第一高校 | |
| 会場：三隅中央公園町民陸上競技場 | ||||||
| 4 | （千葉1） 流通経済大柏高校 | 1 | 0-1 1-3 | 4 | （兵庫） 滝川第二高校 | |
| 23 | （福島） 平工業高校 | 3 | 1-2 2-1 4PK2 | 3 | （愛知2） 愛知高校 | |
| 18 | （北海道2） 札幌山の手高校 | 1 | 0-1 1-0 4PK5 | 1 | （山形） 羽黒高校 | |
| 会場：ひだまりパークみとサッカー競技場 | ||||||
| 14 | （鹿児島） 鹿児島実業高校 | 0 | 0-0 0-0 5PK4 | 0 | （茨城） 水戸商業高校 | |
| 3 | （栃木） 矢板中央高校 | 0 | 0-0 0-1 | 1 | （北海道1） 室蘭大谷高校 | |
| 16 | （滋賀） 草津東高校 | 0 | 0-0 0-0 4PK2 | 0 | （広島） 広島皆実高校 | |
| 会場：島根県立益田産業高等学校グラウンド | ||||||
| 13 | （京都） 洛北高校 | 1 | 0-0 1-2 | 2 | （岡山） 作陽高校 | |
| 22 | （大阪1） 履正社高校 | 2 | 1-0 1-0 | 0 | （長野） 松商学園 | |
| 8 | （神奈川1） 桐光学園 | 3 | 2-0 1-1 | 1 | （石川） 星稜高校 | |
| 会場：島根県立益田工業高等学校グラウンド | ||||||
| 5 | （埼玉1） 西武台高校 | 5 | 3-0 2-1 | 1 | （新潟） 帝京長岡高校 | |
| 17 | （宮城） 仙台育英学園 | 2 | 1-0 1-1 | 1 | （香川） 高松北高校 | |
| 20 | （山梨） 韮崎高校 | 3 | 2-0 1-0 | 0 | （高知） 明徳義塾高校 | |
| 会場：島根県立益田高等学校グラウンド | ||||||
| 10 | （秋田） 新屋高校 | 0 | 0-0 0-2 | 2 | （鳥取） 米子北高校 | |
| 1 | （和歌山） 近大和歌山高校 | 3 | 1-1 2-0 | 1 | （東京1） 堀越高校 | |